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发布时间:1970年01月01日 浏览数:

【据《J Clin Microbiol》2011年9月报道】题:通过多重PCR对医院和社区获得性金黄色葡萄球菌分型的SmaI限制性酶切位点法(作者:AI-Zahrani IA等)

MRSA是院内重要的致病菌,近年来MRSA感染的发病率和死亡率显著升高。为监测MRSA的暴发流行情况,需要可靠的MRSA分型技术。目前常用的分型方法包括脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点序列分型(MLST)、葡萄球菌染色体mec基因盒(SCCmec)分型、葡萄球菌蛋白A基因(spa)分型等。

来自英国纽卡斯尔大学医学院的AI-Zahrani I.等人报道了一种新的金葡菌分型方法—SmaI多重PCR分型(SMT)。作者分析了当前已知基因组序列的金葡菌,发现单核苷酸多态性(SNP)在变异中占主导。随后通过实验筛选出金葡菌基因组中分辨率较高的9个 SmaI限制性酶切位点(CCCGGG)作为研究对象。应用多重PCR检测这9个SmaI位点以及mecA基因的SNP,根据这10个靶基因扩增产物的有无及片段特点对金葡菌进行分型和命名。

研究所用的菌株包括14株参考菌株以及90株收集自英国多家医院的临床菌株。首先在参考菌株的分型中,SMT方法显示出了高分辨率和良好的重复性:除不能区分医院获得性菌株Mu50、Mu3和N315(PFGE可以区分开Mu50和N315)以外,该方法能够区分其余亲缘关系较近的菌株;同时SMT方法与PFGE分型及MLST分型结果具有高度的可比性和一致性。

进一步使用SMT方法对临床菌株进行研究,共发现19种型别(MLST方法分为16种型别);通过与MLST分型和SCCmec分型结果进行比较,三种方法亦显示出受试菌株群组间高度的一致性。总体结果表明:SmaI多重PCR的分辨率高于MLST/SCCmec,略低于PFGE。 SMT符合实用分型技术的要求:简单,重复性好,分辨率高,可在数小时内完成。因此,SMT能够对院内发生的MRSA暴发提供实时监测信息,有望应用于临床微生物实验室的常规工作中。

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